Понимание филогенетических взаимоотношений между игуаноморфными ящерицами открывает новые возможности для понимания происхождения, эволюционной истории распространения и развития родственных связей чешуйчатых рептилий. Основная концепция филогении ящериц рассматривает игуаноморфных ящериц (трёх семейств: Agamidae, Chamaeleonidae, Iguanidae) как монофилетическую группу, родственную всем остальным чешуйчатым. Общее происхождение игуаноморфных ящериц подтверждается фактами, полученными в ходе изучения зубной системы отдельных представителей разных семейств чешуйчатых.